濁水溪屬於中央管河川，發源於合歡山主峰與東峰間的「佐久間鞍部」，全長186.4公里，是臺灣最長的一條河川，入海口為彰化縣大城鄉及雲林縣麥寮鄉，流經四個縣市二十一鄉鎮，包含南投縣、雲林縣、彰化縣及嘉義縣。濁水溪流域面積達3156.9平方公里，排名全台第二，僅次於高屏溪流域，且流速也較急。主要支流有霧社溪、萬大溪、丹大溪、郡大溪、巒大溪、陳有蘭溪、水里溪、東埔蚋溪和清水溪等。它有豐富的自然生態景觀與生態，過去濁水溪源頭直到出海口皆是濁水，是來自其地質特性，由於上游集水區崩塌地多，造成河水含沙量極高，因此溪水混濁。
濁水溪被譽為「母親之河」，水資源非常豐富，在三百多年來臺灣開發過程中，溫柔地滋養了臺灣人民與上千公頃農地，也受到大規模開發，對臺灣農業經濟做出了巨大貢獻。因地質條件關係，其河川污染指數(RPI)偏高，主因為水中懸浮固體(SS)偏高，而濁水溪歷年來水質多介於輕度污染至中度污染，且越上游水質越好。96年起至今，濁水溪嚴重污染長度比率皆為0%，但因受到泥沙影響，水庫容量及水資源循環仍需持續被管理，以滿足民生供水及生態環境健康。主要污染來源為畜牧廢水及生活污水，而因逐步興建污水下水道系統，及強化稽查管制，目前無嚴重污染河段，改善趨勢極為明顯。