• 生物指標的評估法是一種由生物物種所提供的參考依據，讓人們能藉由生物物種的面向來初步研判水質條件，但若要準確評估水質，仍應進行水質檢測，才能準確評估水質條件。
• 已知許多水中生物能廣泛適應多種水質條件，如俗稱琵琶鼠的翼甲鯰屬魚類可以適應從未受污染水質到嚴重污染水質的各種水質環境，如生物指標類別將翼甲鯰屬魚類標註為「嚴重污染水質」的魚類，指的是這個魚種能耐受「嚴重污染程度的水質」，這個耐污染的物種特性在過去多個文獻都曾有述及，但這並不是指牠不能存活於未受污染水質的環境中。例如一處水域環境只發現翼甲鯰屬魚類，但是連其他本該可以出現在該環境，且可耐「中度污染水質」的物種，經調查都確定不存在，且現場目視觀察可見水質明顯不佳，散發明顯臭味，那麼在沒有水質儀器進行水質檢測的情況下，可初步推測該處水域的水質有可能屬於「嚴重污染水質」。上述例子便是用指標生物來評估水質的一個例子。
• 許多水生生物的存在與否，不只受到水質條件的影響，同時也受到溶氧、水溫、鹽度、底質、流速等條件的影響。

綜合以上所述，我們已經知道不能夠單就一種生物的存在與否來直接論斷水質條件，水質檢測數據仍是水質條件的評估標準。但是若沒有水質檢測資料，如想利用生物指標來評估水質，也應該交叉比對並參考多種指標物種，並依據其他水域的環境因子與現場觀察評估，再對於水質條件進行較為準確的推估。如果只針對單一物種的有無就貿然作為評估一處水質條件的唯一依據，所得到的結果很可能不夠準確。

依據各類參考文獻與野外調查結果，各種指標性生物與牠們所能耐受的最差水質條件之參考對照表大致如下圖所示。大家也要切記，生物指標只能做為水質條件的參考依據之一，水質污染程度仍要以水質檢測結果為依據喔!