基地周邊為優質農地、旱作果樹、竹林。河灘地植物相主要維管束植物為大花咸豐草、五節芒、密毛小毛蕨、百喜草、淡竹葉。
依據歷年文獻資料，貓羅溪魚類資源記錄有粗首鱲、鯽魚、泥鰍、吳郭魚、川鰕虎、鯰魚、高身小鰾鮈、羅漢魚、埔里中華爬岩鰍、短臀鮠等，其中陳氏鰍鮀、臺灣鮰、臺灣副細鯽及巴氏銀鮈，皆屬稀有性魚類。