處理單元包括截流設施、地下化沉澱池、生物處理池槽(接觸濾材及礫間)、地上機房(參觀式、儀電、鼓風機及除臭設備)，淨化水取部分先放流至生態池，最後匯集至林厝排水再排至筏子溪。
截流設施－＞進流抽水井－＞細攔污柵－＞除砂器－＞初沉池－＞－＞接觸曝氣槽－＞接觸曝氣槽－＞礫間曝氣區－＞礫間非曝氣區－＞放流槽－＞林厝排水
於林厝排水(市區)截流高當量晴天污水，截流至進流抽水井，經一次動力泵送至前處理單元後重力排至後端生物處理單元，淨化後放流至林厝排水再匯流至筏子溪。