處理系統除截流晴天污水外，亦截流部分林厝排水水體，設有一共構之抽水井，分別揚水至本現地處理系統中進行水質淨化，處理後水放流至林厝排水匯入筏子溪。本水質淨化系統主要處理單元有攔污柵、除砂器、初沉池、接觸曝氣槽、礫間曝氣槽(含曝氣區與非曝氣區)，處理後放流水經放流槽排放。水質淨化過程中，攔污柵單元所攔除之垃圾、雜物等以固體廢棄物清理，除砂器廢砂則就近泵送至廢砂貯槽，定期以人工清理之，初沉池及礫間曝氣槽之反沖洗污泥則排入污泥貯槽中，定期以水肥車清運。
本工程設計可將BOD5自30 mg/L削減至10 mg/L以下，總凱式氮TKN自25mg/L消減至7 mg/L以下，懸浮固體物SS自40 mg/L削減至25 mg/L以下，以淨化水量5,500CMD計算，對於筏子溪而言，每日可削減110kg的BOD5、99kg的TKN、82.5kg的SS進入筏子溪。