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水利工程快速棲地生態評估林厝排水的分數為9分，評估分數總分為80分，此區段評估為9分，佔總分11.25%。各項目最高分為10分，本區段所有項目均低於5分。分數最高者為水生動物豐多度(4分)，後續為水陸域過渡帶(3分)、水質(1分)、底質多樣性(1分)。其他4項分數均為0分，顯示林厝排水區段的生態棲地環境極差。
經過本計畫改善環境後，預期林厝排水本計畫區段整體評估分數可以提升至43分，為佔總分53.8%。預期八個評分項目均可改善，其中有六項可超過5分，分別是水域型態多樣性、水域廊道連續性、水質、水陸域過渡帶、水生動物豐多度、水域生產者。
林厝排水與筏子溪匯流銜接，目前兩區段棲地環境差異極大，若經過本計畫工程改善棲地環境，同時採用前項所研擬的環境友善措施。預期將兩區段的棲地環境同時提升並縮小差異性，提供本區生物更廣泛的生存棲地，也提供附近民眾更良好的生態系統服務功能，生態效益評估、相關生態調查相片摘錄如下。
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