場區主要處理單元包括截流設施、攔污沉砂池、曝氣池、終沉池及放流水池等。主要採接觸曝氣法使生物膜附著於濾料表面，利用此生物膜處理廢水中之有機物質以達淨化水質之功效。污水經截流後，經攔污籠篩除大型雜物，流入沉砂池初步沉降水體砂礫，再重力流方式流至曝氣池，經後端生物處理之處理水再經終沉池處理後進入放流水池再導回原排水溝渠。
琉球鄉本福村老人會館聚落污水處理設施每日處理污水436公噸，生化需氧量平均去除率為91.0%，削減量約26.6公斤/日；懸浮固體平均去除率為97.4%，削減量約72.7公斤/日；氨氮平均去除率為69.0%，削減量約4.6公斤/日。