本淨化設施主體工程完工後於103年5月開始試運轉，104年3月代操作，代操作期間有機污染物(BOD5)、懸浮固體、氨氮平均去除率皆達60％以上，約等於每日消減有機污染物(BOD5)140公斤/日；約等於每日消減懸浮固體218公斤/日；約等於每日消減氨氮452公斤/日，對於改善污染水體有顯著的功效。