主要處理單元包括點源削減設施部分之水質淨化設施預鑄式污水處理設施，並設置多層複合濾料淨化系統(MSL)，增加去氮除磷功能；非點源污染削減設施2處(樟湖生態國中小及湖山水庫)，設置生態截流溝、沉沙池及植生滯留槽，使周邊茶園逕流水體經生態截流溝、沉沙池及植生滯留槽，達到去氮除磷效果。
利用生態工法水質自然淨化系統處理方式，進行水污染物去除、淨化，以降低污染負荷，落實環境保育之目的，營造出具有污染自淨、景觀休憩、生態復育和教育宣導能力的生態工法場址，達到削減污染源，降低湖庫優養化現象。目標總磷去除率為 40%、懸浮固體去除率為 80%、氨氮去除率為 40%。