場區土庫路段主要處理單元包括截流設施、沉砂池、進流抽水井、初沉池、礫間曝氣池及放流池等。主要由沉砂池、初沉池去除部分SS，並經礫間曝氣池以填充礫石或人工濾材，使其表面形成生物膜，以達淨化水質之功效。污水經截流後，經動力方式幫送至沉澱池，主要以去除無機性懸浮固體物；並經後端礫間曝氣裝置處理後，放流至既有流域。信義路段則採用FRP 預鑄式套裝設備進行處理，於箱涵出流前端設置截流設施，將污水將污水引入預鑄式污水處理套裝設備進行處理，最終排至月津港排水。
月津港水淨場於土庫路設計處理水量為730CMD，設計處理水質BOD5放流濃度≦8.7 mg/L或去除率≧85%，SS放流濃度≦8.1 mg/L或去除率≧86%，氨氮放流濃度≦11.5 mg/L或去除率≧77%；信義路設計處理水量為50CMD，設計處理水質BOD5放流濃度≦10.0mg/L或去除率≧75%，SS放流濃度≦13.5mg/L或去除率≧66%，氨氮放流濃度≦10.7 mg/L或去除率≧76%。