虎高污水處理廠流程可區分為前處理(進流抽水站、機械式攔污柵、渦流沉砂池、初沉池)、二級處理(缺氧池、曝氣池、終沉池)及污泥處理(污泥好氧消化池、污泥濃縮機、帶濾式污泥脫水機)等。主要由初沉池、渦流沉砂池及終沉池去除部分SS，並經MLE 系統藉微生物營養鹽氮之代謝機制，於缺氧池將水中的氮營養鹽去除，以達淨化水質之功效。污水經進流站後，除至前處理系統經動力方式運送外，皆以重力流方式進行。
虎高污水處理廠設計處理污水10,000 CMD，生化需氧量(BOD)平均去除率為85.0%、懸浮固體(SS)平均去除率為80.0%。
本案總氮降解系統工程所增設之缺氧池可減少放流水中總氮及氨氮，設計氨氮(NH3-N)平均去除率為95.0%、總氮(TN)均去除率為40.0%。