場區處理單元包括引水口、前處理單元、接觸氧化槽、生物污泥沉澱池、礫間接觸槽及放流池。主要由取水口及前處理單元去除大型污物與垃圾，經由接觸氧化槽去除溶解性污染物，再經由礫間接觸槽讓水中微生物自然生成生物膜，與有機物質附著、吸收及分解，進而達到水質淨化，經各單位處理後放流至既有流域。
東大溪污染整治及環境改善工程，設計處理污水2,000 CMD，針對民生污水，氨氮削減率51.3%、BOD削減率83.9%及SS削減率86.1%。