本濕地採表面流式人工濕地（FWS）設計，操作流程為以管線輸送方式重新截流該股污水，進入場區之進流抽水站後以抽水泵方式引入曝氣區，以曝氣機提升溶氧，再由曝氣區底部之聯通管流入沉澱區，於沉澱區內先去除部分固體物後，經溢流堰溢流出並流入各濕地處理單元內，經濕地處理後之出水經放流渠道流入放流生態區，再排入三疊溪。
截流三疊溪橋下生活污水→進流井→抽水泵→曝氣區→沉澱區→FWS人工濕地(採三段濕地串聯)→景觀水道→放流生態區→原有污水排(重力放流)