玉水圳人工溼地位於花蓮縣玉里鎮設置於秀姑巒溪玉里堤防西側堤尾與卓溪南側堤尾匯流處，溼地面積為約4.95公頃，設計目標為以玉水圳及環保公園東側大排污水為處理對象，利用人工濕地自然淨化系統進行水質淨化，以減輕秀姑巒溪流域水體的污染負荷。
花蓮縣玉水圳水質改善工程於96年2月啟動整治計畫，總工程經費約4,544萬元，由行政院環保署全額補助，目標處理水量為6,000CMD，並於96年12月24日完工驗收；採用A區開放水面區及密植I區與密植II區淨化水質、C區生態池及導覽解說設施。