場區主要處理單元包括取水設施、前處理單元、礫間接觸曝氣單元、表面流水質淨化池等處理後，放流至既有流域。
莿桐腳排水水質改善工程場區，設計處理污水2,000 CMD，設計生化需氧量(BOD)去除率為60%、懸浮固體(SS)去除率為60%、氨氮(NH3-N)平均去除率為40%